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近日，我院园艺所核桃创新团队在国际知名期刊《scientific data》在线发表了题为“A haplotype-resolved genomeprovides insight into allele-specificexpression in wild walnut (Juglans regiaL.)”的研究论文（IF=9.8/Q1），为等位基因特异性表达基因的研究提供了新思路。

野生种质资源因具有特殊性状，对基因挖掘和分子育种至关重要。新疆野生核桃是我国珍稀的野生植物资源，长期的进化过程中形成了许多特有变异，具有很大的研究利用潜力。该团队调查了新疆野生核桃树的基因组大小和杂合性，并使用PacBio HiFi和Hi-C技术组装了单倍型的基因组。其中一个单倍型（hap1）的基因组大小为562.99 Mb（contig N50=34.10 Mb），另一个单倍型（hap2）的基因组大小为561.07 Mb（contig N50=33.91 Mb），分别有527.20 Mb（93.64％）和526.40 Mb（93.82％）的序列挂载到16个假染色体，分别预测了41039和39744个蛋白质编码基因。此外，在两个单倍型基因组之间还发现了123个结构变异（SVs）。最后确定了新疆野生核桃响应冷胁迫的等位基因特异性表达基因（ASEGs）。这些数据集可用于研究核桃亚基因组进化、优良基因挖掘和新疆野生核桃特定环境适应特性的转录基础。

韩立群副研究员为论文第一作者，马凯、许语辉为该论文的通讯作者，新疆农业科学院园艺作物研究所为论文第一完成单位，该研究得到自治区重点实验室“新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室”开放课题、国家自然科学基金项目和新疆生产建设兵团南疆重点产业创新发展支撑计划项目等的资助。（韩立群）。