在番茄的生长发育过程中,极易受到根结线虫胁迫的危害,严重影响了番茄的产量和品质。PAL是苯丙烷类代谢的关键酶和限速酶,在植物中苯丙烷类代谢是一条很重要的途径,其产生的次生产物在植物的生长发育、抗病、抗逆反应中起着重要的作用。近日,我院园艺作物研究所加工番茄团队在Frontiers期刊在线发表了题为“Genome-wide identification and expression analyses of phenylalanine ammonia-lyase (PAL) gene family members from tomato (Solanum lycopersicum) reveal their role in root-knot nematode infection”(IF=6.627)的研究论文。
该研究在栽培番茄和野生潘那利番茄中分别鉴定出14个和11个PAL基因,系统进化分析将其分为三个亚族,不同亚族PAL蛋白在单子叶、双子叶植物中向不同的方向进化。两种番茄的PAL家族基因中发现了广泛的胁迫、生长、激素、光响应相关元件。通过WGCNA筛选出2个共表达基因模块,通过计算模块内基因的连通性来挖掘网络中的核心基因,并进行功能注释。此外,一些栽培番茄PAL基因的表达量在根结线虫胁迫后发生了明显的变化,SlPAL5、SlPAL8、SlPAL11/12的转录水平发生了上调,SlPAL3/4、SlPAL6的转录水平发生了下调。此结果为番茄PAL家族基因功能的研究提供数据参考,也为后续PAL基因在番茄抗虫的选育提供了候选基因。
园艺所研究生张福林、副研究员王娟为论文共同第一作者,园艺所研究员余庆辉、副研究员李宁为该论文通讯作者。新疆农业科学院园艺作物研究所,新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室、省部共建干旱荒漠区作物抗逆遗传改良与种质创新国家重点实验室为完成单位。该研究得到了新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室开放课题、新疆农科院作物重要性状形成与生物育种前沿核心技术攻关专项的支持。(园艺所 李宁 王娟)