国家糖料改良中心乌鲁木齐分中心玛纳斯甜菜基地于2007年6月建设完工投入使用。基地建有种子库房700m²，实验楼623 m²，基因库200 m²，晒场1600 m²，母根贮藏窖400㎡，温室650 m²，试验地150余亩。实验楼内设有检糖室、倍性检测室、病理实验室、生理生化室等，配套仪器设备98台（套）。分中心依托新疆农业科学院经济作物研究所，在原甜菜基地基础上建成，原基地于1972年开始开展甜菜品种选育工作，先后得到过农业农村部、自治区科技厅、自治区发改委、自治区综合开发办等上级部门的大力支持。

团队现有甜菜科研人员13人，其中正高级职称4人，副高级职称5人，在读博士3人，硕士5人，科研辅助人员4人。“十一五”以来，承担了国家糖料产业技术体系甜菜高产高糖品种改良科学家岗位、甜菜水分管理与节水栽培科学家岗位、国家科技部科技成果转化、自治区重大专项项目、重点研发等项目20余项。目前开展的主要研究工作有：甜菜机械化节本增效综合栽培模式集成与示范、优质高抗甜菜种质资源创新及品种引育与推广、甜菜产质量提升与节本增效关键技术研究、甜菜耐盐碱栽培技术与机理研究等，同时结合科技扶贫在南疆甜菜新区开展了技术研究和巡回服务工作。

国家糖料改良中心乌鲁木齐分中心具有开展甜菜品种选育工作的雄厚基础，拥有糖用甜菜品种资源600余份，饲料甜菜种质资源17份，食用红甜菜种质资源8份，并有一批优异的单胚雄不育材料，多胚丰产、高糖、耐褐斑病二倍体材料和抗、耐根病材料。选育出糖用甜菜新品种18个，饲用甜菜新品种3个，食用甜菜新品种1个，糖能兼用型新品种1个：新甜1号、2号、3号、6号、8号、10号、11号、14号、15号、19号、20号、21号、22号、新引Beta 218、XJT9905、XJT9907、 XJT9908、 XJT9909、 XJT9911、新红甜菜1号、新甜饲1号、2号、3号。其中新甜2号、新甜6号都曾在新疆大面积种植，年覆盖面积占种植面积的70%以上。研究形成不同糖区“甜菜节本稳产增糖全程机械化生产技术模式”5套，制定地方标准7项，获得专利12项，出版著作5部。先后获得国家科技进步三等奖1项、自治区科技进步一等奖2项、自治区科技进步二、三、四等奖各1项。新品种、新技术在生产上累计应用面积1500余万亩，产生社会经济效益17.6亿元。甜菜科研及推广服务工作的扎实开展有效提升了我区甜菜综合生产能力，为新疆甜菜糖业高质量发展做出了重要贡献。